くそ忙しいのに（失礼）、マジメに考え込んでしまいました。
なんて親切な管理人。

アンチウイルスソフトやスパイウェア対策ソフトで怪しいモノを除去した後、
という前提でよろしいのですよね？

＞別ウィンドウでサイトを開くにアドレスがリンクされず
＞応急措置として、「ショートカットのコピー」からアドレスをペースト

これから類推するに、つまり、デスクトップ上に置いたショートカットから
ホームページを開こうとしても、アドレスバーが空白で何も表示されない
という症状なんですか？
もしそうでしたら、念のため、新たにショートカットを作り直してから
再度トライしてみて下さい。

それでもダメなら、管理人に出張修理を依頼して下さい（笑）


教養系webサイトを閲覧→エロいサイトを閲覧
研究活動にも支障→家族にみつかりそうでPCを開けない

と読み替えておきましょう。